Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NME9Q86XW9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms