Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCAQ16586 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SGCAQ16586 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms