Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms