Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CUL4BQ13620 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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