Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SEMA3FQ13275 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms