Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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