Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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