Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GRIK3Q13003 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms