Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXF2Q12947 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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