Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GTF2BQ00403 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms