Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ELF3P78545 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELF3P78545 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELF3P78545 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELF3P78545 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELF3P78545 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms