Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKX2-5P52952 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms