Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB28P51157 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB28P51157 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RAB28P51157 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB28P51157 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms