Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA9P31269 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HOXA9P31269 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms