Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSRP1P21291 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms