Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PGAM1P18669 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms