Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMIGD3P0DMS9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMIGD3P0DMS9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms