Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CLDN7O95471 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms