Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms