Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms