Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKAB2O43741 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms