Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C5orf49A4QMS7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C5orf49A4QMS7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms