Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC2Q9Y235 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC2Q9Y235 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms