Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DSEQ9UL01 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms