Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KCNK4Q9NYG8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KCNK4Q9NYG8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms