Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVK-5Q9HDB9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms