Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLIRPQ9GZT3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms