Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRCC1Q9C099 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms