Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms