Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A3Q9BRY0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms