Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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