Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PIK3C3Q8NEB9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PIK3C3Q8NEB9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms