Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMIGD1Q6UXZ0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms