Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ANKRD39Q53RE8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ANKRD39Q53RE8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ANKRD39Q53RE8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ANKRD39Q53RE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ANKRD39Q53RE8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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