Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRY2Q49AN0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms