Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GAPVD1Q14C86 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GAPVD1Q14C86 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
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