Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KLF1Q13351 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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