Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TROQ12816 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TROQ12816 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TROQ12816 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TROQ12816 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TROQ12816 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TROQ12816 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TROQ12816 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TROQ12816 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TROQ12816 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
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