Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
FOXM1Q08050 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms