Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCT3P49368 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCT3P49368 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCT3P49368 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms