Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms