Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNCP24821 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNCP24821 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNCP24821 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TNCP24821 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms