Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ALPIP09923 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ALPIP09923 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms