Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APOL3O95236 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOL3O95236 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOL3O95236 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOL3O95236 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms