Protein–RNA interactions for Protein: O00418

EEF2K, Eukaryotic elongation factor 2 kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF2KO00418 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EEF2KO00418 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms