Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00587B1AMM8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00587B1AMM8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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