Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRRM4A7MD48 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRRM4A7MD48 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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