Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EME2A4GXA9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms