Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP3Q9Y6F1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PARP3Q9Y6F1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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