Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms